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EXPO 40 ans BCCM: Comment fonctionne une collection de matériel biologique?

Bienvenue dans le monde merveilleux des micro-organismes, ou plutôt des micro-héros !

Nous vous emmenons dans un endroit spécial où ces petites créatures sont conservées... nos collections ! 

 

En 1983, exactement trois cents ans après la première observation de micro-organismes par Anthonie Van Leeuwenhoek au moyen du "microscope" qu'il avait lui-même construit, un projet a été lancé en Belgique pour mieux préserver les micro-organismes, afin de les étudier plus avant et de les mettre à la disposition de la science.

Ce projet, 'les Belgian Coordinated Collections of Microorganisms' (BCCM), fète cette année son 40e anniversaire.

 

Qu'est-ce qu'une collection de matériel biologique ?

 

Bien que les micro-organismes nous fassent souvent penser à des maladies et à des infections, la plupart d'entre eux ont un impact très bénéfique sur l'environnement et sur notre vie quotidienne. Plus encore, ce sont de véritables micro-héros dotés de super-pouvoirs !

Les micro-organismes remplissent un très grand nombre de fonctions utiles. Il n'est donc pas étonnant que les microbiologistes travaillent dur pour découvrir de nouvelles espèces et comprendre leur rôle dans l'écosystème. Ils étudient également comment ces organismes peuvent être utilisés pour aider l'homme et la planète.

Pour soutenir cette recherche, des collections de cultures de micro-organismes telles que le BCCM ont été créées. Il s'agit en quelque sorte de grandes bibliothèques de matériel biologique. Ces collections sont cruciales pour les scientifiques dans leurs recherches, mais elles sont aussi incroyablement importantes pour l'industrie. Il suffit de penser aux brasseries, aux entreprises alimentaires, à l'industrie pharmaceutique et à bien d'autres qui leur achètent du matériel à utiliser dans leurs processus de production. Les collections de cultures sont en même temps un endroit sûr où déposer du matériel biologique important.

Lapréservation des micro-organismes, des plasmides et des lignées cellulaires est essentielle pour permettre la valorisation biotechnologique, pour éviter les coûts de réisolement ou de construction et pour prévenir la perte de la biodiversité microbienne. Dans certains cas, le réisolement n'est même plus possible en raison de la destruction de l'habitat ou d'autres facteurs.

Si vous travaillez avec des micro-organismes, il y a de fortes chances qu'ils aient été obtenus par l'intermédiaire d'une collection de cultures ou d'un centre de ressources biologiques (CRB). 

Leurs principaux objectifs sont la préservation, l'étude et la distribution de matériel biologique, ainsi que l'enregistrement des informations qui s'y rapportent.

 

Suivez le parcours des micro-organismes dans la collection

 

1.  ACQUISITION DE NOUVEAU MATÉRIEL BIOLOGIQUE DANS LA COLLECTION

Les micro-organismes sont activement isolés de différents environnements dans le monde entier afin de les étudier. Les échantillons contaminés sont acceptés dans une collection de cultures en
vue de leur identification ou de leur caractérisation.

 

2. ISOLATION ET ATTRIBUATION D’UN NUMÉRO DE COLLECTION

En laboratoire, les microbiologistes isolent les micro-organismes de l’échantillon en leur donnant les nutriments nécessaires et les conditions de croissance optimales et leur attribuent un numéro
de collection ou un identifiant à la souche ou plasmide.

 

3. CONTRÔLE QUALITÉ

On vérifie que le matériel biologique n'est pas contaminé et que les souches sont capables de se développer dans une nouvelle culture. En outre, une empreinte digitale du micro-organisme est établie, à savoir la composition unique de ses protéines, de ses acides gras ou de son ADN. C'est ainsi que l'on sait à quelle espèce appartient l'organisme. La séquence d'ADN des plasmides et (parties) du génome microbien est déterminée afin de confirmer leur authenticité.

En fonction du type de matériel, de la manière dont les échantillons sont entrés dans la collection et de la manière dont ils sont conservés, des contrôles de qualité peuvent être effectués avant ou après la conservation, ou les deux.

 

4. PRÉSERVATION & STOCK

Pour conserver les micro-organismes, la plupart des souches peuvent être lyophilisées (congelées et déshydratées) ou stockées à très basse température dans des congélateurs (- 80°C ) ou des cuves d'azote liquide (- 196°C ). Toutefois, certaines souches ne peuvent être conservées à long terme qu'en les maintenant en culture active continue.

Les plasmides sont conservés à la fois sous forme d'ADN plasmidique congelé et de cultures bactériennes congelées porteuses de plasmides.

 

5. DISTRIBUTION ET SERVICES

Après avoir effectué tous les contrôles de qualité nécessaires, les échantillons de matériel biologique sont distribués aux instituts de recherche, à l'industrie, aux universités, etc. sous différents formats (lyophilisé, ADN, cultures vivantes,...).
Les collections offrent également toutes sortes de services tels que l'identification du matériel biologique, les tests de résistance antimicrobienne, la formation, les analyses bioinformatiques, ...

 

6. APPLICATION

La boucle est bouclée, le matériel biologique distribué sera utilisé dans la recherche ou dans des processus de production industrielle.

 

 

Les collections du BCCM offrent des milliers d'isolats et de souches de référence méticuleusement caractérisés de bactéries (y compris les mycobactéries, les cyanobactéries), de champignons filamenteux et de levures, mais aussi de plasmides, provenant d'une grande variété de sources cliniques et environnementales.

Travaillant dans des conditions de qualité contrôlée, BCCM fournit des organismes viables ou des extraits d'ADN comme ressources pour votre recherche dans des domaines tels que la pathogénicité, le développement de médicaments, la fermentation, l'activité probiotique, les cultures protectrices, les usines cellulaires, ainsi que pour les tests, la validation et les objectifs éducatifs.

En plus de ces ressources microbiologiques inestimables, BCCM offre également une gamme de services pour les analyses microbiennes.

Notre personnel spécialisé est prêt à vous aider à trouver le service adapté à vos besoins professionnels ou académiques spécifiques.

Vous cherchez une formation ? Le BCCM propose des formations pour des groupes ou des individus, sur les techniques d'isolement, de culture et de conservation, ainsi que sur l'identification polyphasique, la taxonomie et la classification.

 

Mais ce sont nos micro-héros qui sont les vedettes de l'expo ! Vous nous accompagnez dans notre découverte ?